ジョン・ウォーカー＆サンズ社は、1820年にスコットランドの南部キルマーノックで創業されました。創業者のジョン・ウォーカーは、当時15歳で家族の大黒柱として食料雑貨店を開業しました。彼のビジネスは成功し、1823年に酒税が引き下げられたことを機に、アルコール飲料の販売を開始しました。

ジョン・ウォーカーは品質の安定を重視し、他の蒸留所からモルト原酒を取り寄せてブレンドすることで、自家ブランドのスコッチウイスキーを製造しました。このウイスキーは「ウォーカーズ・キルマーノック」と名付けられ、一定の知名度を獲得しました。ジョンの死後、息子のアレクサンダーが事業を引き継ぎ、ウイスキー製造に専念するようになりました。アレクサンダーは、鉄道の開通を好機と捉え、生産設備を拡充し、流通販売網を広げました。

1860年頃には、象徴的な四角いボトルと斜めに貼られたラベルが導入され、大量輸送を助けるための工夫が施されました。また、1865年にはブレンデッドスコッチウイスキー「ウォーカーズ・オールドハイランド」の製造を開始し、これが現在のジョニーウォーカーの原型となりました。

1893年には、同社のキーモルトといえるスペイサイドのカーデュ蒸溜所を買収。1909年、アレクサンダーの息子アレクサンダー2世が「ジョニーウォーカー」のブランドを立ち上げ、白ラベル、赤ラベル、黒ラベルの三色が世に送り出された。ブランド名の「ジョニーウォーカー」は、創業者である祖父ジョンの愛称に因んだもので、同時に赤いコートにシルクハットの英国紳士というトレードマークの「ストライディンマン」も誕生した。このブランドはイギリス国内のみならず、海外にも広まりました。

1925年には、ジョンウォーカー＆サンズ社はディスティラーズ社の傘下に入り、さらなる成長を遂げました。1934年にジョンウォーカー＆サンズ社は英国王室御用達を拝命。1986年には、ディスティラーズ社はギネス社に買収され、その後1997年にギネス社はグランドメトロポリタン社と合併し、ディアジオ社が誕生しました。以降現在に至るまで、ジョニーウォーカーのブランドオーナーはディアジオ社となっている。

ジョニーウォーカーの現在のラインナップには、レッドラベル（通称ジョニ赤）、12年（ジョニ黒）、ダブルブラック、ゴールドラベルリザーブ、18年、ブルーラベル、キングジョージ5世などがあり、世界で最も売れているスコッチウイスキーである。